モグラ目（食虫目）

トガリネズミ科

  1. トウキョウトガリネズミ Sorex minutissimus hawkeri
  2. ヒメトガリネズミ Sorex gracillimus
  3. エゾトガリネズミ Sorex caecutiens saevus
  4. オオアシトガリネズミ Sorex unguiculatus

コウモリ目（翼手目）

ヒナコウモリ科

  1. モモジロコウモリ Myotis macrodactylus
  2. ウスリドーベントンコウモリ Myotis daubentonii ussuriensis
  3. ウスリホオヒゲコウモリ Myotis mystacinus
  4. ヒメホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi
  5. カグヤコウモリ Myotis frater
  6. キタクビワコウモリ（ヒメホリカワコウモリ） Eptesicus nilssonii (Eptesicus nilssonii parvus)
  7. チチブコウモリ Barbastella leucomelas
  8. ウサギコウモリ Plecotus auritus
  9. テングコウモリ Murina leucogaster
  10. コテングコウモリ Murina ussuriensis

ネコ目（食肉目）

イヌ科

  1. エゾタヌキ Nyctereutes procyonoides albus
  2. キタキツネ Vulpes vulpes schrencki

イタチ科

  1. エゾクロテン Martes zibellina brachyura
  2. ニホンイタチ Mustela itatsi
  3. イイズナ Mustela nivalis
  4. エゾオコジョ Mustela erminea orientalis
  5. アメリカミンク Mustela vison
  6. ニホンカワウソ Lutra lutura whiteleyi （1955年以降の記録は無い）
  7. ラッコ Enhydra lutris （定着しているか不明）

アシカ科

  1. トド Eumetopias jubatus
  2. オットセイ Callorhinus ursinus

アザラシ科

  1. ゼニガタアザラシ Phoca vitulina
  2. ゴマフアザラシ Phoca largha
  3. ワモンアザラシ Phoca hispida
  4. クラカケアザラシ Histriophoca fasciata
  5. アゴヒゲアザラシ Erignathus barbatus

アライグマ科

  1. アライグマ Procyon lotor （定着しているか不明）

クマ科

  1. ヒグマ Ursus arctos

ウシ目（偶蹄目）

シカ科

  1. エゾシカ Cervus nippon yesoensis

ネズミ目（齧歯目）

リス科

  1. エゾリス Sciurus vulgaris orientis
  2. エゾシマリス Tamias sibiricus lineatus
  3. エゾモモンガ Pteromys volans orii

ネズミ科

  1. エゾヤチネズミ Clethrionomys rufocanus bedfordiae
  2. ミカドネズミ Clethrionomys rutilus mikado
  3. カラフトアカネズミ Apodemus peninsulae giliacus
  4. エゾアカネズミ Apodemus speciosus ainu
  5. ヒメネズミ Apodemus argenteus
  6. ドブネズミ Rattus norvegicus
  7. クマネズミ Rattus rattus
  8. ハツカネズミ Mus musculus

ウサギ目

ウサギ科

  1. エゾユキウサギ Lepus timidus ainu

クジラ目

マッコウクジラ科

  1. マッコウクジラ Physeter macrocephalus

アカボウクジラ科

  1. アカボウクジラ Ziphius cavirostris
  2. ツチクジラ Berardius bairdii
  3. オウギハクジラ Mesoplodon stejnegeri

ネズミイルカ科

  1. ネズミイルカ Phocoena phocoena
  2. イシイルカ Phocoenoides dalli

マイルカ科

  1. カマイルカ Lagenorhynchus obliquidens
  2. シャチ Orcinus orca

ナガスクジラ科

  1. ザトウクジラ Megaptera novaeangliae
  2. ミンククジラ Balaenoptera acutorostrata

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